Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms