Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp54Q8BL06 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms