Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Zcchc4Q8BKW4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc4Q8BKW4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms