Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms