Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW4

4933430I17Rik, RIKEN cDNA 4933430I17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933430I17RikQ8BHW4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms