Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco3Q8BH01 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco3Q8BH01 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms