Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timm29Q8BGX2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timm29Q8BGX2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms