Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Bhlhe23Q8BGW3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Bhlhe23Q8BGW3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Bhlhe23Q8BGW3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Bhlhe23Q8BGW3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Bhlhe23Q8BGW3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms