Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms