Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.3Q85ZW6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.3Q85ZW6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.3Q85ZW6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.3Q85ZW6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.3Q85ZW6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.3Q85ZW6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms