Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc50Q810U5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms