Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms