Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5bQ80Y84 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms