Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ttc28Q80XJ3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc28Q80XJ3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Ttc28Q80XJ3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttc28Q80XJ3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttc28Q80XJ3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc28Q80XJ3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc28Q80XJ3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc28Q80XJ3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc28Q80XJ3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ttc28Q80XJ3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc28Q80XJ3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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