Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc1Q80VQ1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc1Q80VQ1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms