Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma8aQ80VM8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma8aQ80VM8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma8aQ80VM8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma8aQ80VM8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma8aQ80VM8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma8aQ80VM8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma8aQ80VM8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnma8aQ80VM8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnma8aQ80VM8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnma8aQ80VM8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnma8aQ80VM8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnma8aQ80VM8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pnma8aQ80VM8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pnma8aQ80VM8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Pnma8aQ80VM8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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Pnma8aQ80VM8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnma8aQ80VM8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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