Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sestd1Q80UK0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms