Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otop3Q80UF9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otop3Q80UF9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms