Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims3Q80U57 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms