Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Avl9Q80U56 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms