Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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