Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1bQ7TSF1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1bQ7TSF1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms