Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms