Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp397Q7TNK4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms