Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms