Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms