Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ScocQ78YZ6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ScocQ78YZ6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ScocQ78YZ6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ScocQ78YZ6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ScocQ78YZ6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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