Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6aQ78XR0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6aQ78XR0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms