Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SpopQ6ZWS8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SpopQ6ZWS8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms