Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80Q6ZPV2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms