Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms