Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms