Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms