Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf4Q6PFF0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms