Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms