Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Lce3fQ6PAI4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms