Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm2bQ6P1G2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm2bQ6P1G2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms