Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4Q6P1D7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slx4Q6P1D7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms