Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf8Q6DID3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms