Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cep290Q6A078 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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