Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms