Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CltcQ68FD5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms