Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno1Q689Z5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms