Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2bQ64511 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Top2bQ64511 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms