Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PtprdQ64487 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms