Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtprjQ64455 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprjQ64455 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms