Protein–RNA interactions for Protein: Q640P7

Tbccd1, TBCC domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbccd1Q640P7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tbccd1Q640P7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tbccd1Q640P7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tbccd1Q640P7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbccd1Q640P7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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