Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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