Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Defa17Q64016 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms