Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms